Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC5O15511 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms