Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
VGFO15240 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
VGFO15240 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGFO15240 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGFO15240 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VGFO15240 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGFO15240 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGFO15240 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGFO15240 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
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