Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms