Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms