Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOC4-APOC2K7ER74 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms