Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
J3KT08 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
J3KT08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
J3KT08 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
J3KT08 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms