Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms