Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDYE4A6NLX3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms