Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms