Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEIS3P1A6NDR6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEIS3P1A6NDR6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms