Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49BA6NDI0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms