Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM3A6NDB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms