Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms