Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMX2A2RU54 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMX2A2RU54 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms