Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC78A2IDD5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms