Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RQF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms