Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 AC008957.2-201ENST00000618632 396 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SNX18P8-201ENST00000455120 874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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