Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 SCGB2A2-201ENST00000227918 505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 UPF3AP1-201ENST00000413731 1126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 TRIM6-211ENST00000515022 1060 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC025165.2-201ENST00000549477 699 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN2BO60939 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 BRWD1-AS1-201ENST00000423274 691 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LINC00853-201ENST00000429328 661 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 TXK-203ENST00000507351 1153 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 ZNF257-207ENST00000600162 817 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN2BO60939 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms