Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00499-204ENST00000515282 579 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FOXG1-AS1-201ENST00000546560 538 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TAS2R38-201ENST00000547270 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC009154.1-201ENST00000565822 508 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC007952.7-201ENST00000583141 757 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC096708.1-201ENST00000584419 658 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC009971.1-201ENST00000634253 673 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 AC108463.3-201ENST00000603748 1482 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 USP46-207ENST00000508499 1419 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TUBBP9-201ENST00000405234 1099 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL162595.2-201ENST00000430677 792 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KLF7P1-201ENST00000490941 1048 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC010307.4-202ENST00000507403 389 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC007221.1-201ENST00000570038 796 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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