Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GY48 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GY48 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GY48 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GY48 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GY48 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GY48 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms