Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSC4Q9Y5U2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms