Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms