Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXND1Q9Y4D7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXND1Q9Y4D7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms