Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms