Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED7Q9Y3B3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms