Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
THRAP3Q9Y2W1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms