Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCE1Q9Y256 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms