Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNEQ9Y223 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms