Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHOC2Q9UQ13 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms