Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQSEC3Q9UPP2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQSEC3Q9UPP2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms