Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNMA8BQ9ULN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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