Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PADI1Q9ULC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms