Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO4Q9UKT5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms