Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRTO4Q9UKD2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRTO4Q9UKD2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms