Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3Q9UJ98 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3Q9UJ98 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms