Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATPIF1Q9UII2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms