Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms