Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DKK4Q9UBT3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK4Q9UBT3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms