Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD2Q9UBB5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms