Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP36Q9P275 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms