Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HCN3Q9P1Z3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms