Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHRF1Q9P1Y6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms