Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC59Q9P031 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms