Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms