Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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