Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GDAP2Q9NXN4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms