Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC25Q9NXE8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms