Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED17Q9NVC6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED17Q9NVC6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms