Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms