Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms